A utilização do mitogenoma Mus musculus para auxiliar nas práticas educativas em bioinformática

Autores/as

  • Maria Vitória C. Berlofa Universidade de Mogi das Cruzes
  • Mariana da Palma Valério Universidade de Mogi das Cruzes
  • Paulo Sallarola Takao Universidade de Mogi das Cruzes
  • Alessandro Pereira da Silva Universidade de Mogi das Cruzes
  • Daniela Leite Jabes Universidade de Mogi das Cruzes
  • Fabiano Bezerra Menegidio Universidade de Mogi das Cruzes

Palabras clave:

Mus musculus, NCBI, Galaxy, Mapa mitocondrial

Resumen

Objetivo: Proporcionar uma abordagem educacional destinada ao ensino da montagem de genomas mitocondriais aos alunos dos programas de pós-graduação stricto sensu em Engenharia Biomédica e Biotecnologia. Métodos: Para a montagem do genoma mitocondrial utilizou-se o sequenciamento SRR24675123 do NCBI, obtendo 19,8 GB de dados metagenômicos. O processo incluiu análise de qualidade no Galaxy.eu, montagem com NOVOplasty, anotação via mitos2 e verificação taxonômica no NCBI Blast. Resultados: A análise do genoma mitocondrial do Mus musculus, conduzida no Galaxy, destacou uma sequência de alta qualidade, com 119.979.553 sequências, tamanho médio de 101 bases e distribuição de G/C de 46%/54%. O FastQC revelou uma predominância de regiões verdes, indicativas de ótima qualidade. A análise do tamanho das sequências mostrou uma maioria de 101 bases. O mapa mitocondrial gerado no MitoFish exibiu 13 genes, 2 tRNAs e 22 tRNAs, oferecendo uma representação visual atrativa da estrutura genômicae a arvore filogenética nos demonstro. Esses resultados integram métodos educacionais e ambiente estudantil de maneira eficaz. Conclusão: A integração da Bioinformática na educação desempenha um papel crucial na preparação de profissionais para enfrentar os desafios dos avanços científicos e tecnológicos contemporâneos.

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Publicado

2023-12-05

Cómo citar

Berlofa, M. V. C., Valério, M. da P., Takao, P. S., da Silva, A. P., Jabes, D. L., & Menegidio, F. B. (2023). A utilização do mitogenoma Mus musculus para auxiliar nas práticas educativas em bioinformática. Revista Científica UMC, 8(3), e080300089. Recuperado a partir de https://seer.umc.br/index.php/revistaumc/article/view/2032

Número

Vol. 8 Núm. 3 (2023): Especial I Summit UMC

Sección

Summit UMC - Artigo Completo

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